La Reserva fue creada en 1938, siendo uno de los sectores tempranamente protegidos por el Estado chileno; comprende una enorme superficie en la zona del archipiélago de Los Chonos, al oeste del canal Moraleda y al sur de la ciudad de Melinka, además de una parte importante del archipiélago que conforma la comuna de Las Guaitecas, que está constituida por 40 islas e islotes diseminados en un área territorial de 459 km2, entre el canal de Moraleja y el océano Pacífico.

La  Reserva es muy importante debido a la presencia de ballenas, las que se pueden observar recorriendo los diversos canales, y la exuberante flora y fauna autóctona, propia de zonas de alta humedad y precipitaciones durante todo el año. Las islas están cubiertas de una espesa vegetación compuesta de Cipreses de las Guaitecas, Coigue, lenga, ulmo, ñirre, luma y alerces y la fauna se caracteriza por al presencia de por lobos marinos, delfines y una gran variedad de aves.

Tiene más alrededor de 1.097.975 hectáreas y su importancia radica en la protección de la flora nativa ya que compone un ambiente único importante de preservar tanto para chile como para la humanidad.